アジ化ナトリウムの除去
抗体溶液からアジ化ナトリウムを除去する詳細な手順をご覧いただけます。
その他のプロトコール
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アジ化ナトリウムは、抗体溶液で一般的に使用される化学保存剤ですが、その細胞毒性と標識反応の干渉により、高感度な用途では除去が必要です。 アジ化ナトリウムは、プロペラントとして作用する自動車用エアバッグや、げっ歯類や昆虫に対する効果のために使用される害虫駆除剤など、さまざまな製品や用途に使用されている化学物質です。 このアジ化物除去プロトコールは、異なるサンプル量と実験ニーズに合わせた、透析と脱塩の2つの効果的な方法を概説しています。 透析は大量の透析に理想的ですが、脱塩は小さな調製に適しています。 どちらの技術も、抗体が細胞培養と標識のワークフローに安全であることを保証します。
はじめに
アジ化ナトリウムは、抗体製剤の微生物コンタミネーションを防ぐために広く使用されています。 しかし、その存在は、細胞培養や酵素結合アッセイなどの下流アプリケーションに課題をもたらします。 生細胞に対する毒性があり、ホースラディッシュ・ペルオキシダーゼのような酵素を阻害するアジ化ナトリウムは、敏感な生物系で使用する前に除去する必要があります。 アジ化ナトリウム中毒に対する特定の解毒剤はなく、予防と徹底的な除去が特に重要です。 アジ化ナトリウムは酸素の使用を妨げることで心臓、脳、その他の臓器に影響を与える可能性があり、アジ化ナトリウムガスの吸入は、特に密閉された空間での摂取や皮膚接触と比較して最も害を及ぼします。 このプロトコールは、抗体溶液からアジ化ナトリウムを除去するための信頼性の高いガイドを提供し、幅広い実験セットアップとの互換性を保証します。 標識または細胞ベースアッセイ用の抗体を調製する場合でも、このプロトコールは、最適な性能と再現性の達成において研究者をサポートします。
背景と原則
このプロトコールは、分子量ベースの分離とサイズ排除という2つのコア生化学的原理を活用しています。 透析では、アジ化ナトリウム(10–30 Da)を拡散させながら抗体(例、150 kDaのIgG)を保持する孔径カットオフ(65 kDa)の半透過性膜を使用します。 一方、脱塩はセファデックスG25などの樹脂を使用して、サイズに基づいて分子を分離します。 タンパク質精製の一般的な脱塩手順では、脱塩カラムが一般的に使用されます。 これらのカラムは、分子のグループ分離にサイズ排除クロマトグラフィーを利用します。この場合、大きな抗体分子は最初に溶出し、アジ化ナトリウムのような小さなコンタミネーション物質はより長く保持されます。 各脱塩カラムには、分画範囲と除外限界が定義されており、低分子量物質から高分子量タンパク質を効果的に分離するための分子量ウィンドウを決定します。 これらの方法は、低分子量の防腐剤を効果的に除去しながら抗体の構造と機能を保持し、高感度アプリケーションに適しています。
透析装置はメーカーの推奨事項に従って組み立てます。 透析バッファーに装置を入れて、最低1–2分間前処理し、メンブレンを水和させます。
タイムライン番号
1
ステージ1 - 透析
透析装置を用いて、容量0.1~70 mLのサンプルからアジ化ナトリウムを除去することができます。 これは半透過性のメンブレンであり、幅広いサイズと孔径から選択することができます。 孔径カットオフ値が10-30 kDaのメンブレンを用いることで、アジ化物がメンブレンを通過できるようになりますが、抗体およびその他のタンパク質は溶液中に保持されます。
IgGの分子量は150 kDa(IgMは約600 kDa)です。 アジ化ナトリウムの分子量は65 Daです。
透析装置を用いて、容量0.1~70 mLのサンプルからアジ化ナトリウムを除去することができます。 これは半透過性のメンブレンであり、幅広いサイズと孔径から選択することができます。 孔径カットオフ値が10-30 kDaのメンブレンを用いることで、アジ化物がメンブレンを通過できるようになりますが、抗体およびその他のタンパク質は溶液中に保持されます。
透析装置はメーカーの推奨事項に従って組み立てます。 透析バッファーに装置を入れて、最低1–2分間前処理し、メンブレンを水和させます。
抗体溶液を透析装置に移します。
透析装置を、抗体を透析するためのバッファー1 L以上を入れた適切なサイズのビーカーに入れます。 ビーカーをマグネティックスターラーの上に置き、4°Cで最低1時間透析します。
バッファーを交換し、再度1時間以上透析します。 バッファーは、必ず3回以上交換します。
ステージ2 - 脱塩
この手順は、少量(1–3 mL)の場合に適しています。 脱塩樹脂はサイズ排除特性があり、さまざまな孔径の小さな粒子から構成されます。
サイズ排除とは、溶液中の分子を分子量で分離するために使用される方法です。 分子量の異なる粒子は、サイズ排除マトリックスを通して異なる速度で溶出します。 例えば、高分子はマトリックスの孔に入ることができないため、最初に溶出するのに対し、低分子はビーズ内の孔を通過し、後から溶出されます。
Sephadex G25カラムシステムまたは同等品を用いた場合、抗体サンプルからアジ化ナトリウムが効果的に除去されます。 あらかじめSephadexが充填されたスピンカラムはすぐに利用可能で、この手順に使用できます。
必要な資材
- Sephadex G25スピンカラム
- 平衡化バッファー
- 遠心分離機
市販の精製カラムを使用する場合、メーカーの指示を参照ください。
スピンカラムのキャップを外し、1,000x gで2分間遠心分離し、保管溶液を取り除きます。
回収用チューブにカラムを入れます。
メーカーの指示事項に従ってカラムを平衡化バッファーで満たし、1,000x gで2分間遠心分離します。
3回繰り返し、回収したフロースルーを廃棄します。
抗体サンプル1–3 mLをゆっくりと充填層の中央に添加し、1,000x gで2分間遠心分離します。
回収チューブの溶出液(抗体)を回収します。
健康への影響
アジ化ナトリウムは、注意して扱わなければ重大な健康上のリスクをもたらす潜在的に致命的な化学物質です。 アジ化ナトリウムへの曝露は、吸入、摂取、または直接皮膚接触によって起こり得、各経路は深刻な結果をもたらします。 アジ化ナトリウムが酸や水と接触すると、高毒性ガスであるアジ化水素を放出することがあります。 この有毒ガスの吸入は、落ち着きのなさ、脱力感、皮膚の熱傷などの症状を引き起こす可能性があり、重症例では致命的になる可能性があります。 アジ化ナトリウムは、細胞が酸素を利用するのを防ぎ、急速な細胞死を引き起こす可能性があり、特に心臓や脳などの重要な臓器に有害です。 長期または高レベルの曝露は、不可逆的な脳損傷およびその他の長期的な健康効果を引き起こす可能性があります。 これらの危険性があるため、あらゆる実験室でアジ化ナトリウムに関連する健康への影響を理解し、尊重することが重要です。
他の方法との比較
化学沈殿または限外ろ過と比較して、透析および脱塩は、より穏やかで選択的な精製を提供し、タンパク質回収率の向上、最小限の変性、および高感度サンプルとの適合性などのいくつかの利点があります。 透析は大容量に推奨され、複数のバッファー交換で完全に除去されます。 脱塩は、利便性のためにパック済みスピンカラムを使用して、より速く、小規模の準備に最適です。 化学処理とは異なり、これらの方法は、抗体を変性させる可能性のある強力な条件を避け、また、サンプルからヒト血清アルブミンなどのコンタミネーション物質を除去するのに役立ちます。 精製プロトコールを選択する際には、最適な結合と分離を確実にするために、抗体クラスに一致する同じタイプの方法を使用することが重要です。 限外ろ過は小分子を除去することもできますが、タンパク質が不均一に濃縮されたり、特殊な装置が必要な場合があります。 アブカムのプロトコールは、効率、アクセシビリティ、タンパク質の完全性のバランスが取れており、ほとんどのラボ環境にとって実用的な選択肢となっています。
アプリケーション
このプロトコールは、細胞培養、免疫細胞染色、フローサイトメトリー、およびコンジュゲーション反応用の抗体を調製するために不可欠です。 アジ化ナトリウムを含まない抗体は、細胞毒性を回避しなければならない生細胞アッセイにおいて重要です。 除去プロセスにより、酵素結合検出システムとの互換性も保証され、HRPまたはアルカリホスファターゼの阻害を防ぎます。 リコンビナント抗体、治療候補、または診断試薬を扱う研究者は、アジ化物フリーの調製から利益を得ます。 アブカムのキャリア・フリー抗体は、アジ化ナトリウム、BSA、グリセロールを含まないすぐに使用できるソリューションを提供することで、これらのアプリケーションをさらにサポートし、実験ワークフローを合理化します。
偶発的にアジ化ナトリウムに曝露した場合は、直ちに新鮮な空気のある場所に移動し、健康上のリスクを低減します。 汚染された衣服や物質は、コンタミネーションを防ぐために安全な廃棄のためにビニール袋またはビニール袋に入れてください。
デメリット
プロトコールは効果的ですが、サンプル量と装置の可用性に基づいて制限があります。 透析には、磁気攪拌機と低温保存への時間とアクセスが必要で、迅速な処理には適していません。 脱塩は少量(1–3 mL)に制限されており、1回のパスで完全に除去できない場合があります。 さらに、両方の方法は、適切なバッファーの選択と膜または樹脂の品質に依存します。 不完全な平衡または不十分なバッファー交換は、残留アジ化物につながる可能性があります。 また、繰り返し操作すると敏感なタンパク質に影響を与える可能性があるため、精製中は抗体の安定性を確保する必要があります。
トラブルシューティング
一般的な問題には、アジ化物の不完全な除去、低い抗体回収率、サンプル希釈などがあります。 除去効率を改善するには、透析中に少なくとも3回のバッファー交換を行い、新しく適切に平衡化されたバッファーを使用してください。 脱塩については、サンプルの損失を避けるために、カラムの完全性と遠心分離機の設定を確認してください。 抗体濃度が低下した場合には、精製後濃度法を検討してください。 曇りや沈殿はタンパク質の不安定性を示すことがあります。それに応じてバッファーの組成や温度を調整します。 透析ユニットおよびスピンカラムについては、必ずメーカーのガイドラインに従ってください。 持続的な問題が発生した場合、アブカムのキャリア・フリー抗体製品は、精製ステップなしで信頼性の高い代替品を提供します。
安全上の注意と廃棄
タンパク質サンプルでアジ化ナトリウムを取り扱うには、作業員と環境の両方を保護するために、安全プロトコールに厳密に従う必要があります。 必ず手袋やフェイスマスクなどの適切な防護服を着用し、有毒ガスへの暴露を最小限に抑えるために、換気の良い場所またはドラフトチャンバーで作業を行ってください。 偶発的な曝露の場合、アジ化ナトリウムは低濃度であっても重度の健康影響を引き起こす可能性があるため、直ちに医師の診察を受けてください。
アジ化ナトリウムの適切な廃棄が不可欠です。 アジ化ナトリウムやそれを含む溶液は、配管内の金属と反応して爆発性化合物を形成し、水源を汚染する可能性があるため、排水管に決して注いではいけません。 代わりに、透析膜などの半透過性膜を使用して、バッファー交換中にタンパク質サンプルからアジ化ナトリウムを除去します。 少量のサンプルでは、適切な平衡化バッファーを備えた脱塩カラムまたはスピンカラムにより、アジ化ナトリウムなどの低分子量コンタミネーション物質を効果的に除去できます。 アジ化ナトリウムを含むすべての廃棄物は、製造業者の指示および施設のガイドラインに従って、認可された有害廃棄物処理会社を通して回収および処分する必要があります。 これらの方法と安全上の注意に従うことで、検査室でのアジ化ナトリウムの安全な取り扱いと廃棄を確実に行うことができます。